Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms