Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms