Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms