Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Sh3bp5lQ99LH9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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Sh3bp5lQ99LH9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Sh3bp5lQ99LH9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Sh3bp5lQ99LH9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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