Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms