Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gps1Q99LD4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gps1Q99LD4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gps1Q99LD4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gps1Q99LD4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gps1Q99LD4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gps1Q99LD4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gps1Q99LD4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gps1Q99LD4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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