Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Ddb2Q99J79 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Ddb2Q99J79 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Ddb2Q99J79 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Ddb2Q99J79 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Ddb2Q99J79 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Ddb2Q99J79 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Ddb2Q99J79 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Ddb2Q99J79 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Ddb2Q99J79 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Ddb2Q99J79 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Ddb2Q99J79 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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