Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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