Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms