Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms