Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb12Q91Y07 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms