Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Smg8Q8VE18 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Smg8Q8VE18 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Smg8Q8VE18 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Smg8Q8VE18 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Smg8Q8VE18 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Smg8Q8VE18 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Smg8Q8VE18 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Smg8Q8VE18 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Smg8Q8VE18 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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