Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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