Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc12Q8R344 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms