Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim29Q8R2Q0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms