Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud6bQ8K2H2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud6bQ8K2H2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud6bQ8K2H2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud6bQ8K2H2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms