Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms