Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn34c1Q8K193 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn34c1Q8K193 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn34c1Q8K193 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn34c1Q8K193 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn34c1Q8K193 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Cldn34c1Q8K193 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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Cldn34c1Q8K193 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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