Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZK6

Trim61, MCG22896, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim61Q8JZK6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim61Q8JZK6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim61Q8JZK6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim61Q8JZK6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim61Q8JZK6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim61Q8JZK6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim61Q8JZK6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim61Q8JZK6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim61Q8JZK6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim61Q8JZK6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim61Q8JZK6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim61Q8JZK6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim61Q8JZK6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim61Q8JZK6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim61Q8JZK6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim61Q8JZK6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim61Q8JZK6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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