Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnka2ipQ8CH19 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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