Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Hpf1Q8CFE2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Hpf1Q8CFE2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Hpf1Q8CFE2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Hpf1Q8CFE2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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