Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms