Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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