Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E4f1Q8CCE9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms