Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfibp1Q8C8U0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms