Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp20Q8C6M1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp20Q8C6M1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp20Q8C6M1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp20Q8C6M1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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