Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ccdc113Q8C5T8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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