Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX39

Cphx2, Cytoplasmic polyadenylated homeobox, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cphx2Q8BX39 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cphx2Q8BX39 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cphx2Q8BX39 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cphx2Q8BX39 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cphx2Q8BX39 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cphx2Q8BX39 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cphx2Q8BX39 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cphx2Q8BX39 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cphx2Q8BX39 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cphx2Q8BX39 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cphx2Q8BX39 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cphx2Q8BX39 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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