Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ctdsp2Q8BX07 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ctdsp2Q8BX07 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ctdsp2Q8BX07 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ctdsp2Q8BX07 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ctdsp2Q8BX07 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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