Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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