Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q8BPC6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q8BPC6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms