Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zcchc4Q8BKW4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms