Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp1Q8BJQ2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp1Q8BJQ2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp1Q8BJQ2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp1Q8BJQ2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp1Q8BJQ2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp1Q8BJQ2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp1Q8BJQ2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp1Q8BJQ2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Usp1Q8BJQ2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Usp1Q8BJQ2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Usp1Q8BJQ2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Usp1Q8BJQ2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp1Q8BJQ2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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