Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem39bQ810L4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms