Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnupnQ80W37 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms