Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms