Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms