Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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