Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms