Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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ScocQ78YZ6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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ScocQ78YZ6 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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ScocQ78YZ6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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ScocQ78YZ6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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