Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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