Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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