Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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