Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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