Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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