Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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