Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ca4Q64444 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ca4Q64444 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ca4Q64444 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ca4Q64444 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ca4Q64444 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ca4Q64444 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ca4Q64444 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ca4Q64444 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ca4Q64444 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ca4Q64444 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ca4Q64444 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ca4Q64444 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ca4Q64444 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ca4Q64444 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ca4Q64444 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ca4Q64444 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ca4Q64444 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ca4Q64444 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ca4Q64444 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ca4Q64444 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ca4Q64444 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ca4Q64444 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ca4Q64444 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ca4Q64444 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ca4Q64444 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ca4Q64444 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ca4Q64444 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ca4Q64444 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ca4Q64444 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ca4Q64444 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ca4Q64444 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ca4Q64444 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms