Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Zfp248Q640N4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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