Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms