Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Defa17Q64016 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Defa17Q64016 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Defa17Q64016 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Defa17Q64016 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Defa17Q64016 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Defa17Q64016 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Defa17Q64016 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Defa17Q64016 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa17Q64016 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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